Não se sabe data da sua fundação mas já existia em 1758.

Virada a oriente o templo é antecedido por um alpendre, mais estreito que o corpo da igreja. O arco da fachada é fechado por um gradeamento de ferro, os laterais são fechados por panos de tijolo. O frontão é encimado por um campanário com sino.

Sob o alpendre, à entrada da porta existe uma laje tumular marmoreado. Diz a lenda que pertence a uma menina nobre de Vila Alva, que morando em Beja, previu a sua morte na casa em Vila Alva. Igreja de uma só nave, planta rectangular, coberta por uma abóbada de berço dividida em tramos, totalmente pintada com motivos geométricos, arabescos e medalhões, com três cenas alusivas à vida de S. João e uma Nossa Senhora da Conceição. As paredes da nave são totalmente cobertos por azulejos policromos seiscentistas de padrões idênticos na Matriz de Vila Alva.

A cornija é também de azulejos.

Fica situada na Rua de S. João, quase à saída da aldeia perto da estrada que leva Vila Alva a Vila Frades.

As paredes da capela-mor estão revestidas de talha dourada barroca e o altar-mor é de talha policroma barroca/rocócó. No nicho envidraçado a imagem do padroeiro, S. João. Frontal do altar do tipo aves e ramagens séc. XVII.