Na altura da sua construção, em 1630, no reinado de Filipe II de Portugal, os terrenos do local pertenciam a D. Aleixo de Meneses. As Comendadeiras da Ordem Militar de São Bento de Avis tinham então esse convento como refúgio. Alguns anos mais tarde, em 1643, na igreja do convento passou a funcionar a Irmandade das Escravas do Santíssimo Sacramento. Em 1734 sofreu um incêndio. O terramoto de 1755 destruiu parte do edifício, e as freiras foram realojadas para o convento de Santo Antão. A recuperação do edifício terminou em 1758 e as freiras regrressaram.

Exterior

Na fachada pode ser encontrado o brasão de armas da fundadora, D. Maria, filha de D. Manuel.

O Convento da Encarnação, Mosteiro da Encarnação das Comendadeiras de São Bento de Avis ou Recolhimento da Encarnação é um antigo convento localizado no Largo do Convento da Encarnação, freguesia da Pena, em Lisboa.

Está classificado como Imóvel de Interesse Público.