Em 1499, construiu-se neste local a Ermida do Espírito Santo, integrada na restruturação da cidade promovida pelo rei D. Manuel I. Nos finais do séc. XVI, o Bispo D. Afonso Castelo Branco (1581-85) tomou a iniciativa de substituir a capela pela actual Igreja da Misericórdia, com hospital anexo. Um dos aspectos mais interessantes da estrutura é o facto de ser a única no Algarve com planta em cruz grega.

O terramoto de 1755 provocou grandes estragos, que levaram o Bispo D. Francisco Gomes (1795-1815) a remodelar a fachada e a construir um novo hospital, segundo o projecto do arquitecto italiano Francisco Xavier Fabri, a quem se deve igualmente o risco do Arco da Vila, situado do outro lado da praça.

No interior, merece destaque o altar-mor, com um interessante retábulo maneirista dos princípios do séc. XVII. O arco triunfal, profusamente decorado com talha "rocócó", faz a ligação aos retábulos dos dois altares colaterais. A igreja possui ainda um valioso núcleo de imagens do séc. XVIII.

Localização: Praça D. Francisco Gomes.