Entre os séculos XVII e XVIII iniciou-se um período de grandes trabalhos no edifício até ao ano de 1754, mas infelizmente em 1755 ano do grande sismo de Lisboa viria a provocar grandes danos na igreja sendo a capela-mor a mais atingida. A sua degradação fez com que em 2 de Março de 1763 a Mesa da irmandade decidiu para ale da sua reconstrução, construir também um novo hospital, sendo a obra adjudicada em princípios de Abril de 1771 ficando concluída em 25 de Maio de 1775 com inauguração oficial a 28 de Maio.
No ano seguinte a igreja entrou novamente em obras construindo-se e pintando-se os painéis de baixo relevo nos muros, o guarda-vento, os cunhais da frontaria são de granito da região bem como o portal, o altar-mor é de talha dourada com a imagem de Nossa Senhora do Amparo.

Em Fronteira, distrito de Portalegre.

Esta igreja é a expressão de um programa decorativo barroco que se impõe á estrutura arquitectónica, dedicada á Senhora do Amparo acabou de se construir em 1583 e em 10 de Outubro rezou-se primeira missa celebrada por D. António Mendes de Carvalho bispo de Elvas.